秸稈露天焚燒不僅造成資源浪費，而且會(huì )對農田生態(tài)系統造成破壞，直接露天燃燒會(huì )直接導致土壤肥力降低、土壤墑情惡化、土壤微生物數量和多樣性減少。同時(shí)，焚燒過(guò)程中產(chǎn)生的大量污染物會(huì )導致大氣環(huán)境惡化。秸稈焚燒的根本原因，是農民選擇了處置成本最低的方式，這樣成本最低也最省時(shí)間。因此，解決秸稈焚燒問(wèn)題的關(guān)鍵是要為農民找到一種合理化消納秸稈的方式。
經(jīng)過(guò)多年的不斷的探索實(shí)踐，與飼料化、基料化、原料化這幾種有限消納能力的方式相比，秸稈肥料化（還田）利用和燃料化利用都可以實(shí)現秸稈百分之百消納。因此，從消納潛力的角度考慮，兩者似乎不存在差異。但是，通過(guò)研究表明，秸稈還田仍會(huì )對環(huán)境產(chǎn)生不利影響并且也面臨著(zhù)許多現實(shí)問(wèn)題。
從肥田效果看，秸稈還田后能夠釋放N、P、K等營(yíng)養元素，理論上能夠起到肥田和減少化肥使用的作用。但是，在我國實(shí)際的農業(yè)生產(chǎn)過(guò)程中，由于我國秸稈還田需要的精確施肥技術(shù)尚在起步階段，秸稈還田尚未發(fā)揮替代化肥的作用，并且農民習慣過(guò)量施肥，而省去拔節期的追肥，以達到省時(shí)省力的目的。此外，秸稈還田還面臨很多其他現實(shí)問(wèn)題，如過(guò)高的秸稈還田量需要吸收土壤中原有的大量氮素、磷素和水分，會(huì )引起土壤的碳氮比失衡，影響土壤微生物的生長(cháng)繁殖，進(jìn)而影響還田秸稈的腐解、轉化和作物生長(cháng)發(fā)育；當秸稈過(guò)長(cháng)、地溫過(guò)低、松緊度不當時(shí)，不利于秸稈腐解，會(huì )影響出苗和作物生長(cháng)，造成減產(chǎn)；秸稈還田還會(huì )使病原菌重新回到土壤中，長(cháng)期積累會(huì )加重苗期病害和土傳病害的發(fā)生。
生物質(zhì)之所以被認為具有零碳屬性，是由于植物生長(cháng)過(guò)程中會(huì )吸收CO2，將其固定在體內，如果在植物死后這些碳全部還是以CO2的形式釋放出來(lái)，則又會(huì )被新一輪的植物生長(cháng)所吸收，因此從物質(zhì)守恒的角度，可以認為生物質(zhì)具有“碳中和”屬性。但是如果在生物質(zhì)消納過(guò)程中釋放出一定量的CH4、N2O等強溫室效應氣體，由于兩者的全球增溫潛勢分別是CO2的28倍和265倍，則生物質(zhì)的“碳中和”屬性就會(huì )被打破，會(huì )正向增加溫室效應。不管對秸稈等生物質(zhì)資源采取何種消納措施，包括采取自然棄置的方式，整個(gè)過(guò)程中都會(huì )產(chǎn)生一定量的 CH4 和 N2O 排放，所以會(huì )造成不同程度的等效增排量，其中水稻秸稈還田、秸稈做牲畜飼料、林業(yè)廢棄物野外焚燒、秸稈發(fā)酵制沼氣等過(guò)程所帶來(lái)的等效增排量最大。與此相比，將秸稈加工壓縮為成型燃料進(jìn)行清潔可控的燃燒，所排放的 CH4 和 N2O 是所有方式中最少的。
研究表明，將成熟后的秸稈資源通過(guò)清潔高效的燃燒技術(shù)在越短的時(shí)間內將其內部的碳元素迅速轉化成CO2，進(jìn)而作為下一輪作物生長(cháng)的碳源，將越容易維持生物質(zhì)所自有的“碳中和”屬性。否則，不論是采取自然棄置還是其他不合理的利用，過(guò)程中都會(huì )產(chǎn)生 CH4 和 N2O 排放，進(jìn)而加劇溫室效應。
秸稈燃料化利用是我國秸稈資源的規?；罴严{方式，但在利用過(guò)程中需做到清潔高效，最大程度地控制顆粒物和其他各類(lèi)大氣污染物的排放。秸稈成型燃料具有高效、潔凈、點(diǎn)火容易、二氧化碳零排放、便于貯運和運輸、易于實(shí)現產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)和規模應用等優(yōu)點(diǎn)，可為農村居民提供炊事、取暖用能，也可以作為農產(chǎn)品加工業(yè)（糧食烘干、蔬菜、煙葉等）、設施農業(yè)（溫室）、養殖業(yè)等不同規模的區域供熱燃料，同時(shí)可以作為工業(yè)鍋爐和電廠(chǎng)的燃料，替代煤等化石能源。
